南京共27条地铁线路，462个站点（含规划），线路分别为地铁10号线、地铁1号线、地铁2号线、地铁3号线、地铁4号线、地铁S1号线、地铁S3号线、地铁S7号线、地铁S8号线、地铁S9号线、地铁13号线、地铁S8号线南延、地铁3号线三期、地铁S2号线、地铁S5号线、地铁10号线二期、地铁11号线、地铁9号线、地铁5号线、地铁S6号线、地铁S4线、地铁8号线、地铁4号线二期、地铁7号线、地铁12号线、地铁6号线、地铁7号线南段。南京地铁具体营运时间如下：

线路首班时间末班时间站点数10号线安德门-雨山路06:0023:4014雨山路-安德门05:4023:00141号线中国药科大学-八卦洲大桥南05:4723:2732八卦洲大桥南-中国药科大学05:3023:08322号线鱼嘴-经天路06:0023:0030经天路-鱼嘴06:0023:00303号线林场-秣周东路05:5023:0029秣周东路-林场05:4023:10294号线仙林湖-龙江06:0023:0018龙江-仙林湖06:0023:0018S1号线南京南站-空港新城江宁06:0022:409空港新城江宁-南京南站05:5722:409S3号线南京南站-高家冲06:0022:0019高家冲-南京南站06:0022:0019S7号线无想山-空港新城江宁06:0022:009空港新城江宁-无想山06:0022:009S8号线长江大桥北-金牛湖  17金牛湖-长江大桥北06:0022:0019S9号线翔宇路南-高淳06:0022:006高淳-翔宇路南06:0022:00613号线彤天路-沿山大道--33沿山大道-彤天路--33S8号线南延长江大桥北-泰山新村--3泰山新村-长江大桥北--23号线三期秣陵街道-秣周东路--3秣周东路-秣陵街道--3S2号线宁马线)(在建)(当涂南-西善桥--16宁马线)(在建)(西善桥-当涂南--16宁马线)二期(中华门-西善桥--5宁马线)二期(西善桥-中华门--5S5号线宁扬线)(扬州西站-仙林湖--16宁扬线)(仙林湖-扬州西站--1610号线二期东麒路-安德门--11安德门-东麒路--1111号线浦洲路-马骡圩--20马骡圩-浦洲路--209号线江苏大剧院·宪法广场-红山新城--16红山新城-江苏大剧院·宪法广场--165号线方家营-吉印大道--30吉印大道-方家营--30S6号线宁句线)(句容-马群06:0022:0013宁句线)(马群-句容06:0022:3013S4线宁滁线)(滁州高铁站-南京北站--17宁滁线)(南京北站-滁州高铁站--178号线中华门-十月广场--20十月广场-中华门--204号线二期龙江-珍珠泉--7珍珠泉-龙江--77号线幕府西路-仙新路--10仙新路-幕府西路--1012号线金马路-牛首山--20牛首山-金马路--206号线栖霞山-南京南站--20南京南站-栖霞山--207号线南段幕府西路-西善桥--18西善桥-幕府西路--18

本市的地铁经过南京11个地区，分别为(括号为地铁站个数)：雨花台区（33个）、建邺区（38个）、浦口区（66个）、江宁区（85个）、秦淮区（45个）、鼓楼区（51个）、玄武区（32个）、栖霞区（51个）、溧水区（10个）、六合区（13个）、高淳区（2个）。